Фамилия Прохоровский происходит от мужского имени Прохор (дренегреческое ведущий за собой поющих, хореймейстер), которое, очевидно, пришло на Русь вместе с христианством, так как Прохор апостол от семидесяти, один из семи диаконов выбранных апостолами.
Прохоровский фамилия-патроним (от имени отца).
Может быть, что это фамилия польская, шляхетская, на что указывает суффикс ский, а может, и украинская, ополяченная. Ее появление можно отнести где-то к 16-17 веку.
Если же фамилия русская, то скорее всего, происходит от фамилии дворянина польского/украинского происхождения, который был на службе у русского царя и владел крепостными. После реформы 1861 года много бывших крепостных крестьян брали себе фамилии своих помещиков, так как не имели собственных.
Примерно так.