Факультет энергии Объединенного института геномов (Department of Energy Joint Genome Institute, DOE JGI) опубликовал первый отчет о работе над проектом Геномной энциклопедии бактерий и архей (Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea, GEBA). Публикация включает анализ первых 56 геномов двух из трех существующих на Земле видов микробов.
Как говорит директор факультета Эдди Рубин (Eddy Rubin), микробы отвечают почти за каждый биологический процесс на планете. Расшифровка их геномов даст совершенно новый уровень понимания их роли и поможет продвинуться в решении жизненно важных вопросов, в том числе касающихся производства биотоплива и циркулирования углекислого газа в атмосфере планеты.
Проект GEBA, считает руководитель научной группы Джонатан Айзен (Jonathan Eisen) из Калифорнийского университета в Дэвисе (University of California, Davis, UC Davis), отличается тем, что нацелен не на определение конкретных геномов, а больше на построение сбалансированного каталога, дающего представление о разнообразии геномов, представленных на планете. В свою очередь, такой каталог должен облегчить задачу поиска функций геномов и дать толчок вперед нашему пониманию процессов в биосфере.
По оценкам ученых, на планете Земля живет приблизительно нониллион (1 000 000 000 000 000 000 000 000 000 000) микробов. На поверхности земли, в земле, под ней и вокруг нее. Хотя данные о геномах микробов более чем доступны, а около 2000 их геномов уже расшифрованы или приближаются к этому состоянию, у исследователей впереди море непознанного. «Представьте себе такую ситуацию: вы задались целью составить карту мира, но нанесли на нее всего три города и на этом остановились, — говорит Джонатан Айзен. — Здесь примерно то же самое». Всего в рамках проекта планируется расшифровать около пяти тысяч генетических последовательностей.
(Голосов: 1, Рейтинг: 2.93) |
